До мая 2021 года вычет был доступен лишь при переходе на ОСН с УСН «Доходы минус расходы». Причина — только такой бизнес на упрощенке учитывает расходы при исчислении налоговой базы. На УСН «Доходы» никакие расходы не принимаются, а значит, и вычет не положен. Эту позицию поддерживали и Минфин, и суды.
В мае 2021 года Верховный суд постановил, что такой подход противоречит позиции КС, согласно которой переход с УСН на ОСН дает право на вычет упрощенцам с любым объектом обложения. Кроме того, НК напрямую не запрещает это для бизнеса на УСН «Доходы».
Налоговая служба согласилась с выводами Верховного суда. Таким образом бизнес, который переходит с УСН «Доходы» на ОСН, вправе предъявить к вычету НДС по остаткам товаров, купленных во время работы на упрощенной системе.